Разработка основных начал нового Союзного договора была поручена Верховному Совету РСФСР и Конституционной комиссии. Съезд утвердил принципы разграничения функций РСФСР и Союза ССР. В соответствии с ними, в частности, Совет Министров РСФСР подчинялся непосредственно Съезду народных депутатов и Верховному Совету РСФСР, МВД РСФСР подчинялся Совету Министров РСФСР. Совету Министров РСФСР совместно с КГБ СССР поручалось изучить вопрос об образовании КГБ РСФСР и рассмотреть вопрос создания таможенной службы РСФСР. Российский республиканский банк Госбанка СССР реорганизовывался в Государственный банк РСФСР, который передавался в подчинение Верховному Совету РСФСР и наделялся полномочиями в области денежно-кредитной политики. Также образовывался Внешнеэкономический банк РСФСР.
(см.: Постановление Съезда народных депутатов РСФСР от 22 июня 1990 г. «О разграничении функций управления организациями на территории РСФСР (основы нового Союзного договора)» // Ведомости СНД и ВС РСФСР. 1990. № 4. Ст. 63)